Следует различать физиологическую и патологическую линьку. Естественная периодическая (2 раза в год) смена пера  у мелких певчих. При нарушении обмена веществ линька затягивается. При естественной линьке могут быть кровоизлияния в перьевую сумку. Птица может быть в этот период малоподвижна, или наоборот, беспокойной. В этот период у нее активизируется обмен веществ. При физиологической линьке у птицы не должно быть оголенных участков кожи.
Физиологическая линька – первая линька в возрасте 1,5-2 месяца – сброс мелкого оперения. К 12 месяцам меняются все перья. У птиц, содержащихся в неволе, линька происходит два раза в год в течение нескольких месяцев. Не должно быть голых участков без перьев.
Патологическая линька – нарушение перообразования. Причина: при недостатке витаминов, минеральных веществ и серосодержащих аминокислот, из-за отсутствия белков животного происхождения; кормление несвойственными кормами (колбаса, сырое мясо). Ее развитию способствуют нарушения функции печени и почек, а также расстройство гормонной функции. Симптомы. Птица теряет оперение, оно не растет или скручивается, обламывается, неправильно формируется опахало. При нарушении функции печени и почек расстраивается кишечник и линька происходит не в естественные физиологические сроки. Причина: при недостатке витаминов, минеральных веществ и серосодержащих аминокислот, из-за отсутствия белков животного происхождения; кормление несвойственными кормами (колбаса, сырое мясо). При нарушении гормональной функции – изменяется их внешний вид – матовый, взъерошенный, по краям опахала появляется черная окантовка. Птица склонна к ожирению. Дыхание учащенно, изменение цвета восковицы. При плохом освещении происходит угнетение щитовидной железы, в результате деформируются перья.
Алопеция – полная потеря пера. Из-за неправильно подобранного состава рациона и условий содержания. Возможно из-за чрезмерной нагрузки на половую и эндокринную систему при интенсивной и частой эксплуатации птиц в период гнездования.
Аптериоз – частичное выпадение пера и образование бесперьевых участков. Выпадение пера может быть при гепатозах, нефрозах и нефритах при заболевании печени и почек. Нарушение обменных процессов в печени и почках в первую очередь свойственно волнистым попугаям, неразлучникам и арам.
Стрессовая линька – из-за внезапного испуга, резкой смены обстановки, является защитный рефлексом.
"Французская линька" – у молодняка. Симптомы. Выпадение хвостового и крылового, частично контурного оперения. Птица теряет способность к полету, подпрыгивает в клетке или вольере. Причины: недостаток кормления. Мало протеина в зобном молоке. Новое оперение короткое. Птица теряет способность к полету – "бегунки".
Цистоз перьевых фоликуликулов – часто встречается у волнистых попугаев, особенно у самочек. Симптомы. Образуются опухоли различных размеров и формы на груди и животе, заполненные жидкостью, творожистой массой, несформированным пером.